在功能上涉及到給水、排水、通風、排風、強電、弱電、空調、消防、廢氣廢液處理、集中供氣等復雜的工藝技術，同時還要考慮到環保、安全、可持續性發展等諸多因素，因此是一個復雜的系統工程，要做到以下幾點要求。

1、合理定位，科學規劃
在構建專業實驗室的流程中，“構”的部分至關重要，它包括了實驗室的定位和規劃，是整個實驗室建設的基礎和靈魂。
實驗室規劃包括兩個方面：一是實驗室建筑規劃，二是實驗室工藝規劃。實驗室建筑規劃包括建筑外觀、風格、高度、園區布局等；實驗室建設之前，調查實驗室需求的過程實際上就是確定整個實驗室３～５年規劃的過程，因此需要進行大量前期調研工作，既要明晰自身的需求和未來的發展方向又要廣泛地考察相關單位已建成的實驗室，學習其經驗和教訓。此外，還應該從理念上充分認識到專業實驗室建設是一個復雜的系統工程，是對工作環境的構建以及環境造就出的工作方式，而不是儀器和家具的簡單組合。
2、實驗室設計應先于土建設計
“構”應先于“建”，只有“構”清楚了，才可以開始“建”。就是用專業的手段將抽象構思進行具體實現的過程，包括實驗室設計、安裝、調試、維護和升級等。目前，我國對實驗室的建設沒有相關的建筑規范，因此很多實驗室在土建設計階段，沒有充分考慮到實驗室對建筑的特殊要求。正確的實驗室建設流程是首先進行實驗室的工藝設計，然后在滿足實驗室工藝要求的前提下，進行實驗室的土建設計。這就要求建設單位咨詢專業的實驗設計方，在項目的土建設計階段，就及時介入。如有可能最好帶土建設計師一起參觀其他單位的實驗室以加深其認識。
土建比較常見的設計問題：
（1）未設計風井，或者風井的位置、大小、數量不能滿足要求；
（2）未考慮氣瓶室，僅按消防用氣瓶室設計；
（3）未考慮特殊房間功能，如恒溫恒濕室等；
（4）凈層高過低，影響管線布局，裝修后空間低矮。
3、實驗室平面布局的設計
實驗室平面布局是實驗室設計的基礎，只有按照功能分區和工作流程的需求做好相應的平面布局規劃才能確保后續的水、電、風等專業的設計，可謂牽一發而動全身。因此平面布局設計階段應盡可能地詳細考慮工作和發展的需求，合理配置空間，盡量優化整合。除了布局的優化和儀器設備的擺放位置的設計外，還應充分考慮到人員流動與物品流動的方向是否符合工作要求。例如，為了避免實驗人員頻繁跑動，前處理室應該和儀器室在同一樓層；氣瓶室應和氣相色譜儀、氣質聯用儀等儀器在同一樓層；盡量讓單層面積最大化，以避免樓層過多，每一層都要設置洗滌室、樣品室以充分利用空間；生物安全室應合理布局潔凈區、半潔凈區、污染區，以避免交叉污染。　
4、實驗室配電系統
實驗室的配電系統是根據實驗儀器和設備的具體要求，經過專業的設計人員綜合多方面因素設計完成的，與普通建筑有很大區別。因為實驗室儀器設備對電路的要求比較復雜，并不是通常人們所認為的那樣，只要滿足最大電壓和最大功率的要求就可以了。事實上有很多儀器設備對電路都有特殊的要求（例如靜電接地、斷電保護、等電位連接等）。對配電系統的設計，不但要考慮現有的儀器設備情況，同時也要考慮實驗室幾年的發展規劃，充分考慮配電系統的預留問題及日后的電路維護等問題。為了保證電力的可靠保障，還應考慮不間斷電源或雙線路設計，不間斷電源的容量應符合實際所需并保證一定可擴增區間以滿足未來的發展所需。此外對于某些特殊的區域，如氣瓶間則應采用防爆電器元件以確保無安全隱患。墻上的插座應充分考慮需求，例如樣品室應留足冰箱的插座、前處理室應預備離心機的插座、門口應預留自動鞋套機的插座、走廊兩側也應考慮到分布一些插座。
5、實驗室空調系統
空調系統不僅僅是控制實驗室的溫濕度，同時還應實驗室通風系統配合，才能真正有效地保證實驗室的溫濕度和房間壓差，令人員和精密儀器有一個良好的工作環境。實驗室所在的整棟大樓若采用中央空調則一定要能夠進行分區域、分時段的模塊式管理，以避免加班時因不能正常使用空調而影響儀器的檢測性能。中央空調管線的布局應結合實驗室通排風管道的設計，避免施工的時候交錯重疊，影響層高。極端天氣情況下，應能確保樣品室、氣瓶室、超低溫冰箱室、精密儀器室、不間斷電源室等對溫度要求高的區域保持24小時的恒定溫度調節。
6、實驗室消防系統
實驗室是一個特殊環境，對消防的要求相對于普通的辦公樓來說要高很多。實驗室設計要根據實驗室的具體情況（設備投資及工藝特點、實驗工藝要求、儲存樣品和試劑的種類、實驗室建筑物的特點等），采用不同的消防措施來保障實驗室的消防安全。如對于精密儀器室和無菌室、配電室、不間斷電源室而言，其消防就不能采用自動噴淋裝置，而應采用氣體滅火裝置，以避免自動噴淋裝置損壞儀器設備或破壞潔凈環境。
7、實驗室給排水系統
排水系統的管道應耐酸堿腐蝕及有機試劑對材質的融解，應采用ＰＰＲ或其他材質，而不能用普通的PVC管材，同時也要根據污水的性質、流量、排放規律并結合室外排水條件而確定方案。由于大型實驗室下水管道復雜，應采取必要措施避免管道堵塞滲漏，如養成良好的用水習慣、放置濾網、設置存水彎、彎頭采用45°角連接等。集中供水系統由于成本較高，水質不穩定，因此不推薦使用。為了避免二次污染，可采用感應式水龍頭，缺點是容易壞。為了美觀，熱水器可采用內置式的即熱式電熱水器。
8、實驗室集中供氣系統
實驗室的很多設備的運行都需要各種各樣的氣體供應，目前來說以集中供氣作為主流設計方案得到廣泛使用。氣瓶室的安全性必須得到保障，必須采用防爆門、泄爆窗、氣體泄漏感應報警裝置、所有電器電路均應采用防爆型的、還應考慮防雷、防靜電以及空調設備。
9、實驗室通排風系統
實驗室供排風系統是整個實驗室設計和建設過程中規模最大、影響最廣泛的系統之一。供排風系統完善與否，直接對實驗室環境、實驗人員的身體健康、實驗設備的運行維護等方面產生重要影響。通排風系統完善的實驗室，應該是環境和諧、安全、健康的工作場所。實驗室噪音、房間的換氣次數、壓差、通風柜有毒氣體殘留等都是值得關注的問題。另外，樣品室和試劑室也應考慮有通排風設備，以免樣品帶來的異味影響環境；一個現代化的實驗室，應設計新風系統；通風柜前方的新風口散流器應采用可以調節方向活動室百葉設計，以避免冬夏季節外界冷熱空氣直接吹響操作者。